Uy, estás usando una versión muy vieja de NTME... toma, aquí tienes la versión 1.1, más moderna: http://www.2shared.com/file/m__Qaa5_/NTME.html

Si te sigue dando el mismo error, dilo aquí. Creo que sé de qué se trata, pero quizás el NTME nuevo ya lo ha solucionado >.< Pruébalo. De todos modos, para hacer el worldmap no hace falta que abras el raw original con NTME: puedes hacer un nuevo raw desde cero. El mismo programa ya lleva por defecto el tamaño del tilemap para el worldmap de Ruby y de FireRed (mira en el menú "edit->TileMap size->preset sizes").